国药控股南通有限公司主要经营中成药、中药饮片、化学药、生物制品、麻醉药品（含罂粟壳）、精神药品、医疗用毒性药品、药品类易制毒化学品（单方制剂）、体外诊断试剂（药品类）、蛋白同化制剂、肽类激素及医疗器械等的批发。
公司销售规模在南通地区药品分销企业中持续保持领先地位，现直销业务网络覆盖南通市全域，分销业务网络覆盖江苏省全域，是南通地区综合医药供应链服务提供商。
国药控股南通有限公司通过现代化医药物流，高效守护人民用药安全，曾获“江苏省重点物流企业”荣誉称号。
公司物流中心（一期、二期）总投资2亿元，总面积约27000㎡，规划存储28万件，年出货量350万件，是南通地区目前最先进的智能化医药物流中心。2016 年11月，通过省药监局验收，公司取得药品第三方物流资质，曾与默克公司开展第三方物流合作。
一期物流于2014年10月开工建设，2016年8月投入使用，主要包括办公楼5400㎡、仓库10800㎡及辅助设施。一期技改项目于2024年10月上线运行，多穿库配备了“货到人”穿梭车系统、箱式输送系统及配套设备，可实现自动存储和搬运、自动箱拣等。
二期物流于2024年1月正式启用，主要包含立体仓库及四层楼库约11000㎡，可存储货物18万件，采用了堆垛机、机械臂、自动贴标机、五向视觉扫描、螺旋提升机等自动化设备，可实现整托货物的自动出入库及在线自动箱拣。
一期仓库和二期仓库通过连廊连接，实现物流各环节智能化、精细化、可视化管理。
国药控股南通有限公司以践行“健康中国”为宗旨,致力于保障人民健康。近年来，先后开设诊所1家及自有药房10家（均为 DTP 药房）。其中，5家为院内店（即南通大学附属医院、如东人民医院、启东中医院、启东人民医院、启东第二人民医院院内店），5 家为院边店（南通大学附属医院、南通市第一人民医院、南通市肿瘤医院、南通市中医院、如皋市中医院）。目前，公司旗下7家药店已获得双通道资质（恒康堂大药房、如皋万都大药房、端平桥大药房、中南仁愿大药房、先锋药店、启东仁愿店及启东紫薇店）。
国药控股南通有限公司恒康堂大药房：南通市崇川区南大街290号崇川大厦102C室，102D室
国药控股南通有限公司恒康堂大药房曾被国控总部评为“2020 年度十大新零售明星门店”，2022年荣获中国医药商业协会《零售药店经营特殊疾病药品服务规范》达标证书。该药房成立于2018年3月，位于南通大学附属医院眼科大楼旁，是南通市第一批4家特药定点药房之一，也是国谈双通道定点药房之一，是南通地区医保诚信服务信用等级 A级药房之一。药房硬件设施一流，主要设立了特药服务区（含患教室、咨询室）、慢性病服务区、患者休息区、会议室等，并配备了叫号系统，优化服务的同时也提升了工作效率。
国药控股南通有限公司中南仁愿大药房：南通市英诺源科技园8幢103-6室
国药控股南通有限公司如皋万都大药房：如皋市如城街道城建嘉园278幢4室、5室、5-1室
国药控股南通有限公司端平桥大药房：南通市崇川区金恒家园营业用房46室
国药控股南通有限公司如东大药房：如东县城中街道江海西路2号
国药控股南通有限公司启东仁愿店：启东市江海中路753号一楼
国药控股南通有限公司启东紫薇店：启东市紫薇中路458号
国药控股南通有限公司平潮药店：南通市通州区平潮镇建设路16幢108，109，112室
国药控股南通有限公司启东吕四药店：启东市吕四港镇环城南路501号
国药控股南通有限公司先锋药店：南通市通州区先锋街道青年东路688号
2017 年，国药控股南通有限公司积极把握医疗器械行业高速发展的大好机遇成立子公司——国药控股南通医疗器械有限公司，注册资本为人民币1000万元。
2020年6月，公司取得器械第三方物流资质（南通首家）。公司积极推进“药械联动”，紧跟政策、整合资源、持续推动传统器械业态转型，探索搭建新平台、提供新服务、创造新价值的新路径，不断提升器械板块整体竞争力。
为进一步加强与医疗机构的粘合度，子公司国控南通器械大力发展与医疗机构的 SPD 合作项目，在满足医院精益管理需求的同时促使公司器械业务规模逐步提升。2017年以来，子公司营业收入稳步提升。